胰腺导管癌基因异常剪切肽的抗原特异性T细胞检测试剂+抗原肽定量PCR引物

人类基因组中有95%的区域曾被认为是垃圾区域,该区域由“非编码蛋白”的基因组成。这里虽然能产生RNA,但是不产生蛋白质。然而,2025年5月发表于《Science》杂志的“Pancreatic cancer–restricted cryptic antigens are targets for T cell recognition” 挑战了这一传统观念:在胰腺癌中,这些被角落会“异常闪光”,翻译出只在癌细胞中存在的特殊肽段。而且,这些特殊肽段还可以活化T细胞免疫,成为肿瘤免疫治疗的新靶点群。

“非编码蛋白”的基因包括长非编码RNA(long noncoding RNAs, lncRNAs)、基因的5’端和3’端的非翻译区域(5′ and 3′ Untranslated Regions, UTRs),以及基因内部的内含子(intORFs)。但是,这些区域在特定条件下,比如非典型起始位点、移码(Frameshift)等异常机制下会启动表达,被翻译成肽段。这些肽段称为“非经典肽段”(noncanonical peptides)。其表达特征包括如下类型:

图片来自《Pancreatic cancer–restricted cryptic antigens are targets for T cell recognition》 (Science 2025), Canonical ORF = 经典开放读码框; 5′ uORF = 5′ unannotated ORF; 5′ overlap uORF = 5′ overlap unannotated ORF; intORFs = alternative reading frames; 3’dORF = 3′ downstream ORF; 3′ overlap dORF = 3′ overlap downstream ORF; lnRNA = long nocoding RNA

Pancreatic cancer–restricted cryptic antigens are targets for T cell recognition 经过严密的验证,从“非经典肽段”中,发现了胰腺癌组织特异性的7段多肽。根据适应性免疫理论,如果这些神秘抗原只在癌细胞中产生,正常细胞中不表达,它们就可以成为非常理想的T细胞靶点,该研究确认了这7段多肽具有活化T细胞的能力。

7段多肽的发现过程可看全文了解,在此不再赘述。

这7段多肽的抗原特异性T细胞活性经过了以下方法验证,证明了这些多肽具有胰腺癌免疫治疗潜力:

胰腺癌非典型抗原肽表达特性

使用RNA-seq、免疫质谱、Ribo-seq检测11个患者胰腺癌组织类器官后,得出抗原肽的表达方式和患者表达比例。而后,使用抗原肽活化抗原特异性T细胞,并使用单细胞TCR测序获得抗原特异性TCR序列,克隆TCR序列表达于Jurkat-T后测试TCR亲和力。获得如下数据:

基因 抗原肽 编码异常类型 高表达组织占胰腺癌患者的比例 TCR亲和力
INSIG2 HIFHLSLARV 5′ Overlap uORF 50% 低亲和力
DDX47 KLFLWPYKV Out-of-Frame 42% 高亲和力
RB1CC1 LLWRISSSV 3′ dORF 25% 低亲和力
LDHB GAYFFRHLK Out-of-Frame 17% 未测
CTDSPL2 ILQDRLWKL Out-of-Frame 17% 低亲和力
TMED10 RGNLPLPLK Out-of-Frame 8% 未测
NRAS ALFSKLASA 3′ dORF 8% 中等亲和力

胰腺癌非典型抗原肽HLA复合物产品

由于上述7种非典型抗原肽未表达于正常组织,因此是靶向胰腺癌肿瘤细胞极好的靶点。从免疫细胞治疗角度看,这7种抗原肽具有活化T细胞,增殖且活化抗原特异性T细胞的能力,是肿瘤疫苗和免疫细胞治疗的新型靶点。根据文中已验证的结果,我们开发了非典型抗原肽HLA荧光四聚体,用于评估靶向胰腺癌肿瘤细胞的抗原特异性T细胞含量。

基因 非典型抗原肽HLA荧光四聚体 价格
INSIG2 INSIG2-HIFHLSLARV-HLA-A*02:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 7800元/50ug, 12800元/100ug, 19600元/200ug
DDX47 DDX47-KLFLWPYKV-HLA-A*02:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 7800元/50ug, 12800元/100ug, 19600元/200ug
DDX47 DDX47-KLFLWPYKV-HLA-A*32:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 7800元/50ug, 12800元/100ug
RB1CC1 RB1CC1-LLWRISSSV-HLA-A*02:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 7800元/50ug, 12800元/100ug
LDHB LDHB-GAYFFRHLK-HLA-A*11:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 7800元/50ug, 12800元/100ug
CTDSPL2 CTDSPL2-ILQDRLWKL-HLA-A*02:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 7800元/50ug, 12800元/100ug
TMED10 TMED10-RGNLPLPLK-HLA-A*11:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 7800元/50ug, 12800元/100ug
NRAS NRAS-ALFSKLASA-HLA-A*02:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 7800元/50ug, 12800元/100ug

抗原对应的TCR序列可点击:

胰腺癌非典型抗原肽的组织表达定量PCR引物

为了判断胰腺癌组织中是否会表达抗原肽,定量PCR检测抗原肽的RNA是一种简洁快速的方法。我们根据抗原肽定位的转录本,提供了SYBR Green法定量PCR检测引物,供研究者使用。

基因 抗原肽 引物1 引物2
INSIG2 HIFHLSLARV CATATATTTCATCTGTCACTAGCCAGAGTG GCTTGCAATCACATCAGGTGGA
DDX47 KLFLWPYKV AAGCTATTCCTTTGGCCTTACAAGGTC TCCCGAGTCGGGGTAAGAACTAG
RB1CC1 LLWRISSSV CTATTATGGAGGATTTCTAGCTCAGTG TGAATTCTGTGAGCTTATACCTCAC
LDHB GAYFFRHLK GGAGCTTATTTCTTCAGACACCTAAAA GAAGACATTAACATTTCTCTGCACCA
CTDSPL2 ILQDRLWKL ATTCTCCAGGACAGGCTGTGGAAGCTG CCATTGTTTAGTGATGGTCTCACTTGAACTG
TMED10 RGNLPLPLK AGGGGAAATTTGCCTTTACCACTGAAG CAACTTTTGCAATCTCTTCGTAATTTTTCGCC
NRAS ALFSKLASA GCTCTATTCTCTAAACTGGCATCTGCT GTCTACAAACCACTTCTAGGAAAAAGGC

 


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