人类基因组中有95%的区域曾被认为是垃圾区域,该区域由“非编码蛋白”的基因组成。这里虽然能产生RNA,但是不产生蛋白质。然而,2025年5月发表于《Science》杂志的“Pancreatic cancer–restricted cryptic antigens are targets for T cell recognition” 挑战了这一传统观念:在胰腺癌中,这些被角落会“异常闪光”,翻译出只在癌细胞中存在的特殊肽段。而且,这些特殊肽段还可以活化T细胞免疫,成为肿瘤免疫治疗的新靶点群。
“非编码蛋白”的基因包括长非编码RNA(long noncoding RNAs, lncRNAs)、基因的5’端和3’端的非翻译区域(5′ and 3′ Untranslated Regions, UTRs),以及基因内部的内含子(intORFs)。但是,这些区域在特定条件下,比如非典型起始位点、移码(Frameshift)等异常机制下会启动表达,被翻译成肽段。这些肽段称为“非经典肽段”(noncanonical peptides)。其表达特征包括如下类型:

Pancreatic cancer–restricted cryptic antigens are targets for T cell recognition 经过严密的验证,从“非经典肽段”中,发现了胰腺癌组织特异性的7段多肽。根据适应性免疫理论,如果这些神秘抗原只在癌细胞中产生,正常细胞中不表达,它们就可以成为非常理想的T细胞靶点,该研究确认了这7段多肽具有活化T细胞的能力。
7段多肽的发现过程可看全文了解,在此不再赘述。
这7段多肽的抗原特异性T细胞活性经过了以下方法验证,证明了这些多肽具有胰腺癌免疫治疗潜力:
- 抗原特异性T细胞活化
- 单细胞TCR测序
- TCR-T构建与杀伤性评估
- 体内过继性细胞疗法验证
胰腺癌非典型抗原肽表达特性
使用RNA-seq、免疫质谱、Ribo-seq检测11个患者胰腺癌组织类器官后,得出抗原肽的表达方式和患者表达比例。而后,使用抗原肽活化抗原特异性T细胞,并使用单细胞TCR测序获得抗原特异性TCR序列,克隆TCR序列表达于Jurkat-T后测试TCR亲和力。获得如下数据:
| 基因 | 抗原肽 | 编码异常类型 | 高表达组织占胰腺癌患者的比例 | TCR亲和力 |
| INSIG2 | HIFHLSLARV | 5′ Overlap uORF | 50% | 低亲和力 |
| DDX47 | KLFLWPYKV | Out-of-Frame | 42% | 高亲和力 |
| RB1CC1 | LLWRISSSV | 3′ dORF | 25% | 低亲和力 |
| LDHB | GAYFFRHLK | Out-of-Frame | 17% | 未测 |
| CTDSPL2 | ILQDRLWKL | Out-of-Frame | 17% | 低亲和力 |
| TMED10 | RGNLPLPLK | Out-of-Frame | 8% | 未测 |
| NRAS | ALFSKLASA | 3′ dORF | 8% | 中等亲和力 |
胰腺癌非典型抗原肽HLA复合物产品
由于上述7种非典型抗原肽未表达于正常组织,因此是靶向胰腺癌肿瘤细胞极好的靶点。从免疫细胞治疗角度看,这7种抗原肽具有活化T细胞,增殖且活化抗原特异性T细胞的能力,是肿瘤疫苗和免疫细胞治疗的新型靶点。根据文中已验证的结果,我们开发了非典型抗原肽HLA荧光四聚体,用于评估靶向胰腺癌肿瘤细胞的抗原特异性T细胞含量。
| 基因 | 非典型抗原肽HLA荧光四聚体 | 价格 |
| INSIG2 | INSIG2-HIFHLSLARV-HLA-A*02:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 | 7800元/50ug, 12800元/100ug, 19600元/200ug |
| DDX47 | DDX47-KLFLWPYKV-HLA-A*02:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 | 7800元/50ug, 12800元/100ug, 19600元/200ug |
| DDX47 | DDX47-KLFLWPYKV-HLA-A*32:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 | 7800元/50ug, 12800元/100ug |
| RB1CC1 | RB1CC1-LLWRISSSV-HLA-A*02:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 | 7800元/50ug, 12800元/100ug |
| LDHB | LDHB-GAYFFRHLK-HLA-A*11:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 | 7800元/50ug, 12800元/100ug |
| CTDSPL2 | CTDSPL2-ILQDRLWKL-HLA-A*02:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 | 7800元/50ug, 12800元/100ug |
| TMED10 | TMED10-RGNLPLPLK-HLA-A*11:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 | 7800元/50ug, 12800元/100ug |
| NRAS | NRAS-ALFSKLASA-HLA-A*02:01 PE/APC/Alexa Fluor 488 荧光四聚体 | 7800元/50ug, 12800元/100ug |
抗原对应的TCR序列可点击:
胰腺癌非典型抗原肽的组织表达定量PCR引物
为了判断胰腺癌组织中是否会表达抗原肽,定量PCR检测抗原肽的RNA是一种简洁快速的方法。我们根据抗原肽定位的转录本,提供了SYBR Green法定量PCR检测引物,供研究者使用。
| 基因 | 抗原肽 | 引物1 | 引物2 |
| INSIG2 | HIFHLSLARV | CATATATTTCATCTGTCACTAGCCAGAGTG | GCTTGCAATCACATCAGGTGGA |
| DDX47 | KLFLWPYKV | AAGCTATTCCTTTGGCCTTACAAGGTC | TCCCGAGTCGGGGTAAGAACTAG |
| RB1CC1 | LLWRISSSV | CTATTATGGAGGATTTCTAGCTCAGTG | TGAATTCTGTGAGCTTATACCTCAC |
| LDHB | GAYFFRHLK | GGAGCTTATTTCTTCAGACACCTAAAA | GAAGACATTAACATTTCTCTGCACCA |
| CTDSPL2 | ILQDRLWKL | ATTCTCCAGGACAGGCTGTGGAAGCTG | CCATTGTTTAGTGATGGTCTCACTTGAACTG |
| TMED10 | RGNLPLPLK | AGGGGAAATTTGCCTTTACCACTGAAG | CAACTTTTGCAATCTCTTCGTAATTTTTCGCC |
| NRAS | ALFSKLASA | GCTCTATTCTCTAAACTGGCATCTGCT | GTCTACAAACCACTTCTAGGAAAAAGGC |
若您希望获得目标抗原肽的全长转录本序列信息,可扫描客户技术经理微信号。

